更快、更強(qiáng)是基因測序領(lǐng)域?qū)τ诟咝阅苡嬎愕暮诵男枨?/h1>
時間：2022-03-24 11:09:01 | 來源：行業(yè)動態(tài)
時間：2022-03-24 11:09:01 來源：行業(yè)動態(tài)
大家知道基因測序技術(shù)已被列為國家重點發(fā)展產(chǎn)業(yè)。據(jù)研究，每年的基因測序分析增長會在30%以上，數(shù)據(jù)量也將是越來越多，如何傳輸、保存和管理海量的基因數(shù)據(jù)是一個非常棘手的問題。為解決這一現(xiàn)狀，HPC正被廣泛應(yīng)用于基因測序行業(yè)。在目前國內(nèi)基因測序領(lǐng)域，諾禾致源是當(dāng)之無愧的佼佼者，諾禾致源的業(yè)務(wù)覆蓋科技服務(wù)、腫瘤基因檢測及遺傳檢測三大領(lǐng)域，為全球研究型大學(xué)、科研院所、醫(yī)院、醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)、農(nóng)業(yè)企業(yè)等提供基因測序、質(zhì)譜分析和生物信息技術(shù)支持等服務(wù)。其中科研服務(wù)的內(nèi)容是為科研院校、醫(yī)院、藥企提供測序的服務(wù)，從測序到后續(xù)的數(shù)據(jù)分析，最后給到客戶分析報告，以便客戶根據(jù)相應(yīng)的實驗設(shè)計挖掘出數(shù)據(jù)具體的生物學(xué)意義。
包括基因測序在內(nèi)的生命科學(xué)研究對于高性能計算的需求是剛需。隨著基因測序過程數(shù)據(jù)量的增幅速度加快。一方面需要對測序結(jié)果更快的呈現(xiàn)，一方面對于海量數(shù)據(jù)有極高的存儲需求。
諾禾致源高級副總裁吳俊談到基因測序環(huán)節(jié)幾年前需要7到8天，平均每天機(jī)器采集的數(shù)據(jù)量是200到300GB，現(xiàn)在測序環(huán)節(jié)只需要2.5天，但是數(shù)據(jù)量增減到6TB，這就面臨一個問題，測序量又增大，時間減少，如何解決計算的問題。
因此對于高性能計算的需求是一方面是高性能計算的配置要足夠的優(yōu)化，另外針對數(shù)據(jù)量比較大，每次數(shù)據(jù)收回意味著每一次成本都非常高，因此IO的讀寫速度也要跟得上，包括一些并行化的要求，吳俊談到。
同時針對計算量和數(shù)據(jù)量海量的特征以及后續(xù)增長速度高的特點，諾禾致源采用了自建數(shù)據(jù)中心機(jī)房來解決成本以及本身業(yè)務(wù)的特殊性需求。
目前諾禾致源已在全球運行25臺NovaSeq、20臺PacBio Sequel、30臺HiSeq X、11臺HiSeq 2000/2500/4000、4臺MiSeq、4臺NextSeq 500、6臺Life Ion Proton（DA8600）、2臺S5XL和5套Q Exactive HF-X等最先進(jìn)的基因測序儀，建立了亞洲通量規(guī)模最大的基因測序平臺，將實現(xiàn)每年280,000人全基因組測序的超高通量。同時，全國首家引入Q Exactive HF-X高端質(zhì)譜平臺，打造最先進(jìn)的生物質(zhì)譜中心，為客戶提供全面、深入的多組學(xué)解決方案。
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