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除了做實(shí)驗(yàn)和看文獻(xiàn)，聽說隔壁實(shí)驗(yàn)室?guī)熜诌€在用這個(gè)國產(chǎn)數(shù)據(jù)庫 | 癌癥研究數(shù)
時(shí)間：2023-03-13 10:34:01 | 來源：電子商務(wù)
時(shí)間：2023-03-13 10:34:01 來源：電子商務(wù)
今天小編挖到的這個(gè)數(shù)據(jù)庫來自科研熱門領(lǐng)域：癌癥轉(zhuǎn)移。癌癥研究的小伙伴如果要找選題做開題報(bào)告、寫國自然沒思路、不想看文獻(xiàn)...都可以試試LncR2metasta：一個(gè)人工整理的、實(shí)驗(yàn)支持的癌癥轉(zhuǎn)移相關(guān)lncRNA數(shù)據(jù)庫，利用這個(gè)數(shù)據(jù)庫可以輕松了解lncRNA和癌癥轉(zhuǎn)移之間的關(guān)聯(lián)，快速開拓下游研究思路。LncR2metasta是武漢科技大學(xué)鄧文生教授課題組的成果。在當(dāng)前版本中，LncR2metasta記錄了54個(gè)人類癌癥亞型中304個(gè)lncRNAs和39個(gè)癌癥轉(zhuǎn)移事件（縮寫為CME，例如癌細(xì)胞侵襲、內(nèi)滲、外滲、增殖等）之間的1238個(gè)關(guān)聯(lián)。LncR2metasta有哪些功能？
LncR2metasta提供了一個(gè)簡潔的web界面，使研究人員能夠
瀏覽、搜索和
下載以及在數(shù)據(jù)庫中
提交新的lncRNA-CME關(guān)聯(lián)。
lncR2metasta的工作流程示意圖 瀏覽在瀏覽頁面，可以根據(jù)lncRNA和CME類別查看LncR2metasta數(shù)據(jù)，點(diǎn)擊特定的lncRNA或CME后，將顯示匹配條目列表。 搜索在搜索頁面，允許用戶使用lncRNA symbol、ID (Entrez ID、Ensembl ID)或位置查詢數(shù)據(jù)。使用選定的CME，用戶可以有針對(duì)性地高效搜索相關(guān)的lncRNAs。LncR2metasta還提供模糊搜索功能，便于在搜索時(shí)返回最接近的匹配條目。 下載在下載頁面，lncRNA-CME關(guān)聯(lián)可以以定制的方式全部或部分下載。 提交此外，開發(fā)團(tuán)隊(duì)還部署了一個(gè)提交頁面，允許研究人員提交LncR2metasta中沒有記錄的新lncRNA-CME關(guān)聯(lián)。提交記錄一旦被審查委員會(huì)批準(zhǔn)將被納入LncR2metasta。LncR2metasta將成為研究人員了解lncRNA在癌癥轉(zhuǎn)移中功能的一個(gè)有利平臺(tái)。與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中粗略的lncRNA-轉(zhuǎn)移關(guān)聯(lián)相比，LncR2metasta為特定lncRNA在各種CME中的作用提供了多種實(shí)驗(yàn)證據(jù)。
LncR2metasta訪問地址：
http://lncR2metasta.wchoda.com 參考文獻(xiàn)
Shihua Zhang, Xiaolong He, Rui Zhang, Wensheng Deng, LncR2metasta: a manually curated database for experimentally supported lncRNAs during various cancer metastatic events, Briefings in Bioinformatics, Volume 22, Issue 3, May 2021, bbaa178,
https://doi.org/10.1093/bib/bbaa178圖片來源于LncR2metasta和參考文獻(xiàn)，如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除。
關(guān)鍵詞：實(shí)驗(yàn),國產(chǎn),數(shù)據(jù),研究,文獻(xiàn)
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