PCR 引物不用愁，一個網(wǎng)站全搞定
時間：2023-06-05 00:33:01 | 來源：網(wǎng)站運營
時間：2023-06-05 00:33:01 來源：網(wǎng)站運營
PCR 引物不用愁，一個網(wǎng)站全搞定：還在為設(shè)計 PCR or qPCR 引物耗損腦細胞嗎？
還在為 P 不出條帶而不斷摸索條件費時費力嗎？
還在為 P 出了條帶，but，有 N 條條帶而糾結(jié)痛苦嗎？
下面，筆者將介紹一個神奇的網(wǎng)站，只有輸入你想研究的基因名，就能找到合適的引物。
PrimerBankPrimerBank 是一個 PCR 引物的公共數(shù)據(jù)庫。 其引物可以用于 PCR 或 qPCR，共包含超過 306 800 個引物，涵蓋大多數(shù)已知的人和小鼠基因。
有幾種方法可以搜索 PrimerBank 上的引物：GenBank 登錄號，NCBI 蛋白質(zhì)登錄號，NCBI 基因 ID，Gene Symbol，PrimerBank ID 或 Keyword。
下面將以 GAPDH 舉例說明怎么利用 PrimerBank 來查找引物：
1打開網(wǎng)站主界面
2在 search for PCR primer 的
Search by 下拉菜單中選擇想通過所查基因的什么信息來查找引物，一般知道基因名稱的話，選擇 NCBI gene symbol（如果不知道所查基因的基因名是否為 gene symbol，則選 Keyword。例如大家熟知的 β-acting，其 gene symbol，也就是官方大名其實是叫 ACTB）；
在
Species 中選擇物種 human or mouse；
For text 中填入想查基因的 gene symbol；
之后，
Submit；
可以看到針對 GAPDH 的不同對引物，具體序列，長度，Tm 值以及在其 cDNA 上位置等一些列信息
點擊「Click here for cDNA and amplicon sequence」，可以得到這對引物擴增的片段序列及位置：
紅色標(biāo)記為上下游引物，藍色標(biāo)記為引物之間的擴增序列：
超級方便有木有，大家快去試試吧～
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