時(shí)間：2022-11-08 12:30:01 | 來源：信息時(shí)代
時(shí)間：2022-11-08 12:30:01 來源：信息時(shí)代
SNP數(shù)據(jù)庫 : 描述生物分子序列變化的序列數(shù)據(jù)庫,其主要代表是dbSNP單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫。
(1) dbSNP: 包括SNPs,小范圍的插入/缺失,多態(tài)重復(fù)單元和微衛(wèi)星變異。dbSNP還包含種族特異的頻率和基因型數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)條件,分子上下文,及中性多態(tài)和臨床變異的定位信息。它是1998年由NCBI與人類基因研究所合作建立的,迄今已經(jīng)歷了多次改進(jìn)。它接收來自任何物種或者一個(gè)基因組的變異的提交。
(2) Entrez SNP:提供6種搜索方式: ①通過別名或者25種不同的搜索關(guān)鍵字組合:這些關(guān)鍵字和別名可以在Entrez SNP Site里找到; ②通過ID號(hào):這些標(biāo)識(shí)符包括參照SNP(refSNP)聚類號(hào)、已經(jīng)提交的SNP訪問號(hào)(SS#)、本地ID、Celera ID、Genank訪問號(hào)以及STS訪問號(hào); ③提交信息查詢: 包括提交者、新數(shù)據(jù)、檢驗(yàn)變異的方法、種群、出版信息等;④批處理:用其他查詢收集的變異ID號(hào)集合來批量產(chǎn)生大量的SNP報(bào)告; ⑤基因座信息: 此查詢最初被LocusLink完成,現(xiàn)已被EntreZ Gene所取代;⑥標(biāo)號(hào)間信息: 完成已經(jīng)被映射到有兩個(gè)STS標(biāo)記界定的特定基因組區(qū)域的變異檢索。
除了上述的dbSNP數(shù)據(jù)庫以外,還有TSC、HGVbase、HapMap和dbQSNP等數(shù)據(jù)庫,它們與單倍體型(haplotype)的研究比較緊密。
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