使用benchling網(wǎng)站設(shè)計sgRNA
時間:2023-06-02 06:51:02 | 來源:網(wǎng)站運營
時間:2023-06-02 06:51:02 來源:網(wǎng)站運營
使用benchling網(wǎng)站設(shè)計sgRNA:
網(wǎng)站:
1.通過Google賬號登陸或者創(chuàng)建新的賬號
2.創(chuàng)建新的項目:create→CRISPER→CRISPER guides
3.導(dǎo)入序列
(1)自己粘貼序列
- 填寫Sequence Name:例如設(shè)計GFP-sgRNA(用于nontarget),然后下一步。
- 選擇single guide
- Guide Length:20 bp最合適
- Genome:GRCh38(hg38,Homo sapiens)人源基因組(最新的),根據(jù)靶向的細(xì)胞決定,如HEK293T,則選擇GRCh38。如果靶向小鼠、果蠅,請選擇其他類型。
- 根據(jù)on-target score和off-target score進(jìn)行選擇
如選擇:CAACTACAAGACCCGCGCCG AGG